crystal_distance プログラム仕様
- crystal.crystal_distance.main()[ソース]
結晶の格子情報と原子間距離を計算し、結果を出力するメイン関数。
この関数は、lattice_parameters と sites グローバル変数で定義された情報に基づき、 以下の処理を実行します。
実空間の格子ベクトル、メトリックテンソル、単位胞体積を計算し、標準出力に表示します。
逆空間の格子ベクトル、逆格子メトリックテンソル、逆格子単位胞体積を計算し、標準出力に表示します。
rmin と rmax で指定された範囲内で、全ての原子ペア間の原子間距離を計算します。 この際、周囲の単位胞（nxmax, nymax, nzmax の範囲）に存在する原子も考慮します。
計算された原子間距離を昇順にソートし、各距離と関連するサイト情報、単位胞のオフセットを標準出力に表示します。