alamode_xyz2cif 実行例

help出力 alamode_xyz2cif.py --help

Warning in tkprogvars.py: Environment variable tkProg_Root is not given
   tkProg_Root is speculated from the script path [D:\git\tkProg\sphinx\tkProg\docs\source\crystal\alamode_xyz2cif.py]

time at startup: 26/03/22 20:49:29

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Found the argument [--help] for help:
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time at startup: 26/03/22 20:49:29
time at end: 26/03/22 20:49:29
Elapsed time from startup to end:  0.0003169 sec
Usage: python alamode_xyz2cif.py [--inputfile=val] [--logfile=val] [--infile=val] [--outfile=val] [--symprec=val] [--draw_range=val] [--max_distance=val] [--atom_alpha=val] [--displacement=val] [--sleep=val] [--time_step=val] [--nstep=val] [--kr=val] [--bond_r=val] [--vector_r=val] [--vector_length=val] [--arrow_length_ratio=val] [--coordinate=val] [--site_name=val] [--fontsize=val] [--legend_fontsize=val] 
  Options:
    --inputfile=val (def=anime.in) (type=str)
        inputfile
    --logfile=val (def=k25.log) (type=str)
        logfile
    --infile=val (def=vmd_data_k25_k2/ik2.anime01.xyz) (type=str)
        infile
    --outfile=val (def=structure.cif) (type=str)
        outfile
    --symprec=val (def=1e-05) (type=float)
        symprec
    --draw_range=val (def=2,2,2) (type=str)
        draw_range
    --max_distance=val (def=2.75) (type=float)
        max_distance
    --atom_alpha=val (def=0.5) (type=float)
        atom_alpha
    --displacement=val (def=0.2) (type=float)
        displacement
    --sleep=val (def=0.01) (type=float)
        sleep
    --time_step=val (def=0.05) (type=float)
        time_step
    --nstep=val (def=100) (type=int)
        nstep
    --kr=val (def=200.0) (type=float)
        kr
    --bond_r=val (def=3.0) (type=float)
        bond_r
    --vector_r=val (def=1.5) (type=float)
        vector_r
    --vector_length=val (def=2.0) (type=float)
        vector_length
    --arrow_length_ratio=val (def=0.3) (type=float)
        arrow_length_ratio
    --coordinate=val (def=fc) (type=str)
        coordinate
    --site_name=val (def=as) (type=str)
        site_name
    --fontsize=val (def=16) (type=int)
        fontsize
    --legend_fontsize=val (def=12) (type=int)
        legend_fontsize

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生成されたデータファイル

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生成された画像一覧

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